Одиннадцать выходцев из Мюнхенского гимнастического общества, в котором футболу не уделялось достаточного внимания, собрались в ресторанчике «Гизела». Там решили основать футбольный клуб. И 27 февраля 1900 года ими был основан клуб «Бавария».
В первые пятьдесят лет своего существования «Бавария» не часто показывала удачную игру. В 1964 году в «Баварию» пришел новый атакующий полузащитник Франц Беккенбауэр.
Став одним из лучших игроков мирового футбола, новый полузащитник сделал «Баварию» одной из самых популярных современных команд не только Германии, но и в мире. Сам Франц Беккенбауэр стал президентом футбольного клуба «Бавария» в 1994 году.
В общей сумме с 1957 года «Бавария» тринадцать раз завоевывала Кубок ФРГ, стала четырехкратным чемпионом Кубка европейских чемпионов и обладатель Кубка УЕФА 1996 года.