Установлен Постановлением Правительства Кыргызской Республики от 16 ноября 2006 года № 801
12 февраля 2004 года Законодательным собранием Жогорку Кенеша Кыргызской Республики принят Закон Кыргызской Республики «Об органе Кыргызской Республики по контролю наркотиков».
Закон определил место и роль органа Кыргызской Республики по контролю наркотиков в системе исполнительной власти Кыргызской Республики, устанавливает основные задачи, права и ответственность, гарантии правовой и социальной защиты, порядок их финансирования и материально-технического обеспечения.
Статья 26 Закона «Об органе Кыргызской Республики по контролю наркотиков» установила, что день принятия считать Днем сотрудника органа по контролю наркотиков.